Diferență între cADN și Biblioteca Genomică | cADN vs ADN-ul genomic

Anonim

Diferența cheie - ADNc vs biblioteca genomică

Există două tipuri majore de biblioteci ADN construite de oameni de știință folosind tehnici de inginerie genetică. Acestea sunt biblioteca cADN și biblioteca genomică. Diferența cheie între ADNc și biblioteca genomică este că biblioteca cADN conține ADN-ul complementar donat de ARNm total al unui organism, în timp ce biblioteca de ADN genomic conține fragmentele clonate ale întregului genom al unui organism. Biblioteca de ADN genomic este mai mare decât biblioteca cADN.

CUPRINS> 1. Prezentare generală și diferență cheie

2. Ce este biblioteca cADN

3. Ce este Biblioteca Genomică

4. Comparație comparativă comparativă - ADNc vs Biblioteca Genomică

5. Rezumat

Ce este o bibliotecă genomică?

O bibliotecă de ADN genomic este o colecție de clone care poartă fragmentele ADN-ului genomic total al unui organism. Acesta conține întregul ADN genomic al acelui organism, inclusiv secvențe de codificare și necodificare. Construcția unei biblioteci genomice se realizează prin tehnologia ADN recombinant urmată de clonare (inginerie genetică). Există diferite etape implicate în construcție, după cum se arată în figura 01. Procesul începe cu izolarea genomică a ADN-ului. Folosind un protocol de extracție ADN adecvat, ADN-ul genomic total al unui organism ar trebui izolat. Apoi, ADN-ul trebuie transformat în dimensiuni controlabile sau în fragmentele specifice prin endonucleaze de restricție (enzime de tăiere a ADN-ului). ADN fragmentat trebuie inserat în vectori care utilizează ligaze ADN (enzime de legare a ADN-ului). Un vector este un organism care se auto-replică. Plasmidele și bacteriofagii sunt vectori utilizați în mod obișnuit în tehnologia ADN recombinant. Acești vectori ligați sunt cunoscuți ca molecule de ADN recombinant, deoarece aceștia poartă atât secvențe ADN proprii, cât și inserate. Vectorii recombinanți sunt adăugați la o bacterie gazdă și sunt făcuți pentru a absorbi vectorii recombinanți din interiorul celulei bacteriene. Bacteriile cu vectori recombinanți (plasmide) trebuie cultivate într-un mediu de cultură. În timpul multiplicării bacteriene, ADN-ul bacterian, împreună cu plasmidele recombinante, reproduc genomii și produce clone. Aceste clone conțin genomul întreg al organismului sursă. Prin urmare, se numește o bibliotecă genomică. Plasmidele pot fi ușor separate de ADN-ul cromozomial bacterian pentru a construi biblioteca genomică a acelui organism. Dacă un anumit organism conține gene interesate, este ușor de detectat în biblioteca genomică prin hibridizare utilizând sonde moleculare (markeri).

Bibliotecile genomice sunt importante pentru a studia structura și funcția genomică, gene specifice, localizarea genei, cartografierea genelor, mutații, secvențierea genei, identificarea genelor terapeutice noi, etc.

Figura_1: Construirea unei genomice

Ce este o bibliotecă de cADN?

O bibliotecă cADN este o colecție de clone ADN complementare (cADN) sintetizate din ARNm total al unui organism. Procedura de construcție implică pași diferiți. Purificarea ARNm total de la un organism este primul pas implicat. Izolat ARNm sunt transformate în catene cADN printr-un proces numit transcripție inversă. Transcrierea inversă este facilitată de o enzimă numită revers transcriptază. Se folosește un primer mic de 3 'și se inițiază sinteza primei catene cADN complementare la catena de mRNA template. CADN-ul dublu catenar rezultat este transformat în fragmente mai mici utilizând endonucleaze de restricție și inserat în vectori adecvați. Aceste molecule recombinante construite sunt apoi adăugate într-un organism gazdă și crescute într-un mediu de cultură pentru a produce clone. Colectarea de clone care conțin fragmente cADN ale unui organism este cunoscută ca o bibliotecă cADN. LTRN maturul complet feliat nu conține introni și regiuni de reglare. Prin urmare, fragmentele necodificatoare nu sunt prezente în bibliotecile cADN spre deosebire de o bibliotecă genomică.

Bibliotecile cADN sunt importante pentru analiza regiunilor de codificare, funcțiile genei, exprimarea genelor etc.

Figura_2: Construcția unei biblioteci cADN

Care este diferența dintre cADN și Biblioteca Genomică?

- diff Articol Mijloc înainte de masă ->

cADN vs Biblioteca Genomică

biblioteca cADN este o colecție a clonelor care poartă ADN complementar la ARNm al unui organism

Biblioteca genomică este o colecție a clonelor care poartă ADN-ul genomic total al unui organism.

Secvențele de codificare vs noncoding

biblioteca cADN conține numai secvențele de codificare; nu conține intronuri. Biblioteca genomică constă în întregul ADN genomic incluzând ADN-ul necodificat (introni și regulatori).
Dimensiunea
biblioteca cADN este mică. Biblioteca genomică este mare.
Material inițial
Materia primă este mRNA Materia primă este ADN.
Implicarea transcrierii inverse.
Transcripția inversă are loc în prima sinteză a catenei cADN. Transcrierea inversă nu se întâmplă.
Rezumat - cADN și Biblioteca Genomică
Biblioteca genomică reprezintă o populație de clone care poartă ADN-ul genomic total fragmentat al unui organism. biblioteca cADN reprezintă populația de clone care poartă ADN complementar al mARN-ului total al unui organism. O clonă cADN conține numai secvențele găsite în mRNA, în timp ce clona genomică conține secvențele întregului genom. Aceasta este diferența dintre cADN și biblioteca genomică. Referință:

1. Haneef, Deena T KochunniJazir. Diferența dintre Biblioteca Genomică și ADNc. Diferența dintre Biblioteca Genomică și ADNc. N. p., n. d. Web. 15 Feb.2017

2. Stekel, Dov J., Yoav Git și Francesco Falciani. "Compararea expresiei genice din mai multe biblioteci cADN. "Genome Research. Cold Spring Harbor Laboratory Press, decembrie 2000. Web. 16 februarie 2017

3. "Ecrane de biblioteci genomice pentru genele implicate în toleranța la n-butanol în Escherichia coli. "Ecrane de biblioteci genomice pentru genele implicate în toleranța la n-butanol în Escherichia coli. N. p., n. d. Web. 16 februarie 2017

Datorită imaginii:

1. "Formarea unei Biblioteci cADN" de către doctoratul Dre în limba engleză Wikipedia (CC BY-SA 3. 0) prin Wikimedia Commons

2. "Biblioteca genomică de construcție" de Aluquette - Activitate proprie (CC BY-SA 3. 0) prin Wikimedia Wikimedia