Diferența dintre genotipare și secvențiere | Genotipare vs. Secvențiere

Diferența cheie - genotiparea vs. secvențierea

Genotiparea și secvențializarea sunt două tehnici efectuate pentru a obține informații despre acizii nucleici, în principal ADN-ul unui organism. Diferența cheie dintre genotipare și secvențiere este că genotiparea este procesul de determinare a variantei genetice pe care o posedă individul folosind markeri în timp ce secvențierea este determinarea ordinii corecte a secvenței de nucleotide din fragmentul dat al ADN-ului.

CUPRINS> 1. Prezentare generală și diferență cheie

2. Ce este genotiparea

3. Ce este Sequencing

4. Comparație comparativă - genotipare vs. secvență

5. Rezumat

Ce este genotiparea?

Genotiparea este determinarea genetică a unui individ folosind o secvență de ADN și markeri și compararea și identificarea moștenirii sale. Genotiparea este importantă în biologia evoluționistă, biologia populației, taxonomia, ecologia și genetica organismelor. Se poate realiza prin diferite tehnici, inclusiv secvențierea ADN, reacția în lanț a polimerazei, polimorfismul lungimii fragmentelor de restricție (RFLP), detecția polimorfă amplificată aleator, polimorfismul lungimii fragmentelor amplificate (AFLP), microarraysele ADN etc.

Genotiparea implică secvențierea unor fragmente mici de secvențe ADN și găsirea relației compoziției genetice cu alte indivizi care utilizează markeri genetici. Acesta determină polimorfismele singulare de nucleotide (SNP) dintre indivizi sau alelele specifice. Genotiparea este aplicabilă la o gamă largă de organisme, inclusiv la oameni. Este, de asemenea, aplicabil microorganismelor precum viruși, ciuperci etc. și poate fi utilizat pentru a determina variantele lor genetice cu profilurile de referință. În epidemiologia moleculară și în microbiologia medico-legală, controlul agenților patogeni, în special al microorganismelor, se face prin informațiile obținute din genotipări. Genotiparea este foarte importantă în analiza pedigree. Oamenii sunt genotipați pentru a confirma maternitatea și paternitatea. Genotipul va dezvălui alelele dominante și recesive ale genelor care determină trăsături specifice.

Figura_1: Genotiparea RFLP

Ce este secvențierea?

Secvențierea este procesul de determinare a ordinii corecte a nucleotidei într-un fragment dat de ADN sau ARN. Practic toate informațiile necesare pentru creșterea și dezvoltarea unui organism sunt codificate în genomul său. Disponibilitatea tehnicilor pentru producerea și separarea fragmentelor de acizi nucleici cu lungimea de câteva sute de nucleotide a dus la dezvoltarea procedeelor ​​de determinare a secvenței nucleotidice exacte a unui fragment dat de ADN sau ARN.Diferite tipuri de metode de secvențiere sunt disponibile astăzi. Aceste metode de secventiere, impreuna cu tehnologiile de construire a bibliotecilor genomului care reprezinta genomul intreg al unui organism, faciliteaza secventierea intregului genom al acelui organism, facand analiza aprofundata a structurilor genetice, functiile genei, locatiile genei, expresiile genetice, regiuni de reglare a genei etc.

Genomele totale ale mai multor viruși, mai multe bacterii, arheebacterii, drojdii și câteva alte organisme au fost secvențiate și cartografiate. Proiectul genomului uman a făcut posibilă secvența și cartografia întregului genom uman și publicarea primului său proiect în 2003. Este o etapă importantă în dezvoltarea biologiei. Secvențele genomului uman sunt acum utilizate în sectorul medical pentru a identifica cauzele genetice ale bolilor rare, riscul bolii ecranului la nou-născuți, identificarea detaliilor genetice ale diferitelor tipuri de cancer, dezvoltarea de noi terapii și dezvoltarea de noi instrumente de diagnostic etc., genomul de orez și genomul Arabidopsis au fost secvențiate. Cunoașterea acestor secvențe va transforma, fără îndoială, înțelegerea noastră cu privire la modul în care funcționează celulele și organismele.

Figura_2: Un autoradiograf de secvențiere Sanger

Care este diferența dintre genotipare și secvențiere?

- diff Articol Mijloc înainte de masă ->

Genotipare vs. secvențiere

Genotiparea este procesul de determinare a compoziției genetice a unui individ și de verificare a grupului sau a taxonomiei acestuia.
Sequencing este procesul de determinare a ordinii precise a nucleotidelor unui ADN sau a unui fragment de ARN dat.	Tehnici
RFLP, secvențierea genetică, PCR, microarramele ADN, AFLP etc.
Sequencingul Sanger, secvențarea Gilbert, Pyrosequencing, Secvențierea următoarei generații, îngrijorat dacă diferențele dintre genotip dau diferențele fenotipice reale.	Acest lucru este mai preocupat de ordinea nucleotidelor și diferențele și schimbările cu alte organisme.
Rezumat - Genotipare vs. secvențiere
Genotiparea și secvențializarea sunt utile pentru studierea informațiilor genetice ale organismelor. Genotiparea este procesul de determinare a variațiilor genotipului în rândul indivizilor și de găsirea categoriilor acestora. Sequencingul este procesul de determinare a ordinii corecte a nucleotidelor în fragmentul interesat sau în regiunea ADN. Ambele tehnici oferă informații importante despre gene și genomuri.	Referință:

1. "Metode de genotipare. "Metode în biologia moleculară (Clifton, N.J.). Biblioteca Națională de Medicină din S.U.A., nr. d. Web. 20 februarie 2017.

2. Akey, J. M., D. Sosnoski, E. Parra, S. Dios, K. Heister, B. Su, C. Bonilla, L. Jin și M. D. Shriver. Analiza curbelor de topire a SNP (McSNP®): o abordare fără gel și ieftină pentru genotipizarea SNP. "BioTechniques 30. 2 (2001): 358-67. Web.

Amabilitatea imaginii:

1. "Genotiparea RFLP" De (necunoscut) - Institutele naționale de sănătate (Domeniul Public) prin Wikimedia

2."Fluorescent radioactiv" de Wikipedia (CC BY-SA 3. 0) prin Wikimedia